En 2009, FeSalud puso en marcha su propósito de constituir una Agrupación de Empresas Innovadoras (AEI) para abordar proyectos de iniciativas Free/Libre Open Source Software (FLOSS) aplicadas a la eSalud. En la actualidad más de 50 entidades han mostrado su compromiso de adhesión a esta iniciativa, cuya finalidad es fomentar actuaciones de investigación, desarrollo e innovación en código abierto aplicadas a la eSalud, que sean referente en el tejido productivo andaluz y nacional.

El Cluster Iniciativas FLOSS aplicadas a la eSalud, promovido por FeSalud, se encuentra en proceso de acreditación por parte del Ministerio de Industria, Turismo y Comercio, como Agrupación de Empresas Innovadoras, paso previo para comenzar a desarrollar sus objetivos.